第2軍第5師占泰和、吉安，向樟樹前進。第14軍擊潰吉水之敵，向永豐追擊。第2軍主力在峽江、仁和渡贛江，于十月上旬在新淦地區與直軍激戰后，占領永泰，繼而不戰而下樟樹、豐城，向南昌推進。在此期間，直軍一部進占湖北大冶、鄂城，一部進抵通山、崇陽，威脅武昌。國民革命軍前敵指揮部告急。第7軍為解其危，采取“圍魏救趙”之計，由陽新迅速潛入贛北，威脅九江、德安，迫直軍西進之師東調，在箬溪地區全殲直軍謝師后，于10月3日進至南潯鐵路中段德安地區，遭直軍4個旅抗擊，經激戰斃俘敵各千余人，占領德安。孫大帥急調南昌、九江和已進入鄂東南的部隊反擊。第7軍被迫撤至箬溪，稍事休整后，再攻德安，終因孤軍無援，于7日撤至德安、箬溪間的羅家鋪地區，雙方形成對峙。與此同時，位于奉新的第6軍和第1軍第1師強渡修水河，占領永修，遭由包圍，被迫突圍轉移至永修西北的白槎。第3軍經新喻激戰后，10月2日在萬壽宮地區殲滅直軍2000余人。8日進至牛行、樂化地區，又與直軍遭遇，鏖戰至12日，終因直軍不斷增援，第3軍傷亡甚重，前進受阻。在此不利情況下，蔣司令仍令第2軍和第1軍第2師于10月11日強攻南昌。由于守軍預有準備，憑借堅城深壕死守，并利用夜暗組織反擊，攻城部隊連攻三日不克，傷亡甚重，被迫于13日撤退國民革命軍總司令部總結三次攻打南昌失利的教訓，在于孫大帥軍隊控制南潯鐵路主要干線，便于機動。于是決定集中兵力，先破南潯鐵路各要點之敵，爾后再取南昌，并決定從武昌增調第4軍入贛作戰。國民革命軍入贛部隊分三路于11月1日開始總攻。右翼軍右縱隊第14軍在第2軍配合下，先期于10月20日攻占撫州，切斷孫大帥軍隊入閩通路，從東南向南昌推進。左翼軍第7軍于11月2日攻占德安，第4軍在獨立第2師和第7軍一部配合下，于3日攻占馬回嶺后，第4、第7軍主力在德安以南的九仙嶺擊敗直軍2個師，截斷南潯鐵路，向永修推進。獨立第2師在九江、瑞昌間的曬湖橋殲滅直軍1個師，至7日占領九江、瑞昌、湖口和武穴，第6軍于11月3日開始向樂化攻擊，遭直軍多次反擊，傷亡甚重，后總預備隊第1軍第1、第2師趕到，協力攻擊，于4日占領樂化、永修。此時，右翼軍右縱隊第2軍主力已由進賢、三江口進逼南昌，右翼軍左縱隊第3軍在第2、第1、第7、第6軍各一部配合下，于11月7日占領牛行，繼向余干方向追擊，在滁槎俘敵1.5萬人。孫大帥見敗局已定,乘船逃回南京。南昌守軍待援無望，棄城潰逃，被殲萬余人。11月8日，國民革命軍占領南昌。

    孫大帥連遭失敗，求援于奉軍，聯合組成安國軍，張大帥任總司令，孫大帥和張宗昌任副司令。計劃以奉軍一部入河南，促吳大帥反攻湖北；孫大帥反攻江西；張宗昌率直魯聯軍接防蘇、皖北部,配合反攻鄂、贛。孫大帥收集殘部8萬余人，部署在滬寧鐵路和滬杭鐵路沿線及皖南地區，抗擊國民革命軍的進攻。

    為肅清長江下游之敵，國民革命軍總司令部于1927年1月上旬決定進軍杭州、上海，會攻南京。江右軍（由第6、第2軍和獨立第2師組成）和江左軍（由第7、第10、第15軍組成）分由贛、鄂沿長江兩岸向皖、蘇推進，主攻南京。第1、第14、第17、第19軍和第26軍自贛、閩分路入浙，奪取杭州、上海，助攻南京。第8、第4、第9、第11軍由鄂入豫，牽制北面之敵。

    1927年1月下旬，東路軍第1、第26軍在第2軍配合下，由浙江衢州向杭州方向發起進攻，在龍游附近擊潰直軍一部，于二月上旬進占蘭溪、金華后，乘勝向淳安、建德、浦江推進。2月11日，在桐廬、諸暨、富陽地區遭直軍孟昭月等部4個師抵抗，激戰五日，俘敵8000余人，于2月18日占領杭州。此時，共產黨為配合國民軍進攻上海，發動了第二次工人武裝起義，并在共產國際人員指導下進行軍事布置，起義得到了廣大群眾的擁護和支持，在國民軍先頭部隊的配合下，經過浴血奮戰，起義取得了勝利。

    第14、第17軍和第1軍一部由閩入浙，相繼攻占臨海、寧海、寧波、紹興等地，肅清浙江境內的直軍。3月上旬，東路軍開始進攻淞、滬，至20日，第14、第17、第2軍和第1軍一部經太湖以西攻克常州、丹陽等地，截斷滬寧鐵路；第1軍主力和第26軍克松隱、松江、吳江、蘇州，迫近上海。21日，周恩來等領導上海工人舉行第三次武裝起義，經過30多個小時激戰占領上海。第1軍一部乘機進入上海市區。

    與此同時，江左軍由鄂東向安慶、廬州“挺進。由于直軍殘部相繼起義，3月4日不戰而下安慶，至18日進至廬州、六安之線。江右軍由江西沿長江南岸東進，相繼攻克蕪湖、當涂后，3月20日開始總攻南京，經兩天激戰，掃清江寧鎮、秣陵關、龍都等外圍據點。23日，第2軍進逼中山門、光華門；獨立第2師進攻通濟門、武定門；第6軍進抵雨花臺，該軍第19師由中華門沖入城內。當晚江右軍各部分路進城，占領